Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igsf9Q05BQ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms