Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms