Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fmn1Q05860 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmn1Q05860 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fmn1Q05860 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms