Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms