Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms