Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smarcad1Q04692 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms