Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RelaQ04207 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms