Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms