Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp11Q02853 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms