Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms