Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms