Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnb1Q02248 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms