Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms