Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uba1Q02053 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms