Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms