Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HmgcrQ01237 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms