Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms