Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms