Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms