Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms