Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VegfaQ00731 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms