Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Il6stQ00560 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Il6stQ00560 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Il6stQ00560 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Il6stQ00560 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Il6stQ00560 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Il6stQ00560 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Il6stQ00560 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Il6stQ00560 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms