Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc1P98083 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms