Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AlkP97793 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlkP97793 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AlkP97793 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AlkP97793 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AlkP97793 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AlkP97793 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AlkP97793 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AlkP97793 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AlkP97793 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AlkP97793 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlkP97793 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AlkP97793 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AlkP97793 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AlkP97793 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AlkP97793 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AlkP97793 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AlkP97793 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AlkP97793 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AlkP97793 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AlkP97793 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AlkP97793 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AlkP97793 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AlkP97793 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AlkP97793 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AlkP97793 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AlkP97793 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AlkP97793 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AlkP97793 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AlkP97793 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AlkP97793 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AlkP97793 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AlkP97793 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms