Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cry1P97784 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms