Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcc1P97496 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc1P97496 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms