Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlbpP97440 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlbpP97440 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlbpP97440 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlbpP97440 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms