Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LystP97412 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LystP97412 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LystP97412 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LystP97412 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LystP97412 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LystP97412 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LystP97412 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LystP97412 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LystP97412 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LystP97412 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LystP97412 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LystP97412 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LystP97412 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LystP97412 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LystP97412 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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