Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1b3P97370 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms