Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec1P97353 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec1P97353 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec1P97353 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms