Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim43bP86448 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms