Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3f3aP84244 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms