Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprn2P80560 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprn2P80560 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms