Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms