Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctps1P70698 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctps1P70698 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms