Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms