Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufd1P70362 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufd1P70362 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms