Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms