Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms