Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgif1P70284 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms