Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp3P70281 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms