Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4bP68372 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms