Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps17P63276 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms