Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbdP63072 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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UbdP63072 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbdP63072 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbdP63072 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UbdP63072 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbdP63072 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbdP63072 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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