Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms