Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uba52P62984 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uba52P62984 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms