Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps3P62908 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps3P62908 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms