Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms