Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rps29P62274 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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