Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itga11P61622 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga11P61622 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga11P61622 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms